Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20518E9Q548 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms