Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Vmn2r56E9Q4U5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Vmn2r56E9Q4U5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Vmn2r56E9Q4U5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn2r56E9Q4U5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms