Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
5430401F13RikE9Q328 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5430401F13RikE9Q328 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms