Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc171E9Q1U1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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