Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3250E9Q1M3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3250E9Q1M3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms