Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zfp558E9Q1J0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Zfp558E9Q1J0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Zfp558E9Q1J0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp558E9Q1J0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Zfp558E9Q1J0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp558E9Q1J0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp558E9Q1J0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp558E9Q1J0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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