Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3893E9Q1I1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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