Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms