Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5415E9PXF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5415E9PXF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms