Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp54bE9PXC0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.7 ms