Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30dE9PWL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim30dE9PWL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30dE9PWL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms