Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3002E9PW72 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3002E9PW72 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3002E9PW72 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3002E9PW72 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3002E9PW72 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3002E9PW72 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms