Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc144bE9PVZ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc144bE9PVZ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms