Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6904E9PVF1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6904E9PVF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6904E9PVF1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6904E9PVF1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6904E9PVF1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm6904E9PVF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6904E9PVF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms