Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms