Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3676D3Z236 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3676D3Z236 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms