Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc13D3YV10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc13D3YV10 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms