Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm17333C6EQI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm17333C6EQI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm17333C6EQI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm17333C6EQI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm17333C6EQI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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