Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmf1B9EKI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms