Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20547B8JJN0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms