Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms