Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms