Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms