Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf518bB2RRE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms