Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf39A2RT81 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms