Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga8A2ARA8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms