Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam205aA2APU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms