Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin4A2AMM0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cavin4A2AMM0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin4A2AMM0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms