Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl2A2AFH2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl2A2AFH2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms