Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Calcoco2A2A6M5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calcoco2A2A6M5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms