Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul4bA2A432 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul4bA2A432 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul4bA2A432 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul4bA2A432 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms