Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ino80eA0A0U1RP99 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms