Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A0U1RNP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RNP2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms