Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms