Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm24556-201ENSMUST00000104547 130 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 4933427I22Rik-202ENSMUST00000153921 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms