Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3550W4VSN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms