Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt6bQ9Z331 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms