Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Homer1Q9Z2Y3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer1Q9Z2Y3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms