Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ap3b1Q9Z1T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ap3b1Q9Z1T1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms