Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clic1Q9Z1Q5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms