Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfkbiaQ9Z1E3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfkbiaQ9Z1E3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms