Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms