Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
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ArcQ9WV31 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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ArcQ9WV31 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ArcQ9WV31 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ArcQ9WV31 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms