Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pus1Q9WU56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pus1Q9WU56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms