Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms