Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkab1Q9R078 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkab1Q9R078 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms