Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
AmfrQ9R049 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmfrQ9R049 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms