Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms