Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Exo1Q9QZ11 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exo1Q9QZ11 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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