Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11aQ9QYE3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11aQ9QYE3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms